Le lecteur trouvera ici la totalité des patronymes, français et étrangers, cités par l'historien. Ils sont particulièrement nombreux : les membres de l'aristocratie royale et guerrière naturellement, persuadés d'être les moteurs de l'Histoire, les puissances spirituelles ennemies des Réformateurs, papes, jésuites, mais aussi, et c'est un des intérêts majeurs de l'ouvrage, des noms de roturiers ou de bourgeois qui ne figurent nulle part ailleurs, huguenots ou catholiques : Aubigné ne s'intéresse pas qu'à son camp. Cet index comporte aussi, en italique, un certain nombre de thèmes qu'Agrippa d'Aubigné n'a pas traités pour eux-mêmes, mais qu'il aborde dans son récit et qui reviennent assez souvent pour qu'on puisse dire qu'il leur accorderait beaucoup d'intérêt.