Hubert Bost est directeur d'études à l'Ecole Pratique des Hautes Etudes ainsi que Doyen de la Section des sciences religieuses.

Ses champs de recherche se concentrent particulièrement sur l'Histoire de la Réforme et du protestantisme à l'époque moderne ; les articulations entre conviction religieuse et pensée rationnelle dans la production des écrivains huguenots aux XVIIe et XVIIIe siècles en Europe ; la pensée de Pierre Bayle (1647-1706) et collaboration à l'édition de sa Correspondance ; la pensée de La Beaumelle (1726-1773) et codirection de l'édition de sa Correspondance.