La Christianismi Restitutio (1553) presse les chrétiens de reconstruire leur foi sur une vraie connaissance de Dieu et du Christ, fondée non sur le dogme et l'autorité, mais sur la Bible, à la lumière de ses langues d'origine et de l'histoire. Servet y complète un système ébauché dans ses traités de jeunesse et propose au croyant une praxis digne de l'Évangile. Érasmien, il critique le dogme trinitaire et soutient la théorie des "dispositions" de Tertullien et d'Irénée. Philosophe et médecin, il unit l'Écriture sainte et la sagesse des Gentils dans une cosmogonie au centre de laquelle l'homme s'unit au Christ. Contestant les enseignements luthériens, il renouvelle la vision du péché originel, du baptême et de la circoncision, et décrit le règne de l'Antichrist.